Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME8Q8N427 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME8Q8N427 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms