Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDUFAF2Q8N183 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFAF2Q8N183 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms