Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTROBQ8N137 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTROBQ8N137 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTROBQ8N137 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms