Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC65Q8IXS2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC65Q8IXS2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC65Q8IXS2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms