Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC50Q8IVM0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms