Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPFIBP1Q86W92 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIBP1Q86W92 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIBP1Q86W92 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms