Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC84Q86UT8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC84Q86UT8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms