Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBBP6Q7Z6E9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBBP6Q7Z6E9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBBP6Q7Z6E9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms