Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3Q7Z3Z2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3Q7Z3Z2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms