Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q71RC1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q71RC1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q71RC1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q71RC1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q71RC1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q71RC1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q71RC1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q71RC1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q71RC1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q71RC1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q71RC1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms