Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB1D4Q6XE38 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms