Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NSMFQ6X4W1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMFQ6X4W1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMFQ6X4W1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms