Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MUC6Q6W4X9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MUC6Q6W4X9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms