Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRSAM1Q6UWE0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms