Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA5Q6Q788 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA5Q6Q788 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms