Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFWD3Q6PCD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFWD3Q6PCD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms