Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms