Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPECC1LQ69YQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms