Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN13Q68D06 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN13Q68D06 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms