Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf220Q5T0J3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf220Q5T0J3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms