Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EMC4Q5J8M3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EMC4Q5J8M3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms