Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D3Q587I9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms