Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAN2Q504Q3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAN2Q504Q3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms