Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX19Q49B96 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX19Q49B96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms