Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RNF212Q495C1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF212Q495C1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms