Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTU2Q2VPK5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTU2Q2VPK5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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