Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
FHOD3Q2V2M9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FHOD3Q2V2M9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FHOD3Q2V2M9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms