Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC142Q17RM4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC142Q17RM4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
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