Protein–RNA interactions for Protein: Q16718

NDUFA5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA5Q16718 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA5Q16718 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA5Q16718 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms