Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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FXNQ16595 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FXNQ16595 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
FXNQ16595 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
FXNQ16595 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FXNQ16595 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FXNQ16595 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FXNQ16595 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FXNQ16595 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FXNQ16595 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FXNQ16595 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FXNQ16595 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FXNQ16595 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FXNQ16595 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FXNQ16595 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FXNQ16595 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FXNQ16595 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FXNQ16595 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FXNQ16595 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FXNQ16595 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FXNQ16595 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FXNQ16595 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FXNQ16595 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FXNQ16595 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FXNQ16595 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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