Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NTRK3Q16288 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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