Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMCHL1Q16048 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms