Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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