Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP11Q15643 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP11Q15643 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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