Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TTF1Q15361 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF1Q15361 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms