Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC41Q15345 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC41Q15345 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms