Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCA4Q14CN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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