Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GINS1Q14691 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GINS1Q14691 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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