Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BECN1Q14457 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BECN1Q14457 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BECN1Q14457 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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