Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CNGB1Q14028 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNGB1Q14028 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNGB1Q14028 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms