Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL49Q13405 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL49Q13405 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms