Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL28Q13084 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL28Q13084 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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