Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC16Q13042 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC16Q13042 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC16Q13042 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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