Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 TAF14YPL129W 735 nt3.96□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 POC4YPL144W 447 nt3.96□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 EFM2YBR271W 1260 nt3.96□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RIT1YMR283C 1542 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YOL153CYOL153C 1746 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 APC4YDR118W 1959 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 NOP8YOL144W 1455 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YCL076WYCL076W 744 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 ATP5YDR298C 639 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 BMT5YIL096C 1011 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 GON7YJL184W 372 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TVP38YKR088C 1014 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 SEC65YML105C 822 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TOM7YNL070W 183 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 SLZ1YNL196C 897 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 CYC2YOR037W 1101 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 SSP2YOR242C 1116 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MUM2YBR057C 1101 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MTR10YOR160W 2919 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 SIP1YDR422C 2448 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RRI1YDL216C 1323 nt3.95□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TAF7YMR227C 1773 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 NMD3YHR170W 1557 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MIC26YGR235C 702 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RUF20RUF20 443 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 SEN1YLR430W 6696 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MSN4YKL062W 1893 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RSC3YDR303C 2658 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 PAH1YMR165C 2589 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 BUD6YLR319C 2367 nt3.94□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RAD1YPL022W 3303 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YCR007CYCR007C 720 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 PCL2YDL127W 927 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 snR7-SsnR7-S 179 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RAD27YKL113C 1149 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 UAF30YOR295W 687 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YPR142CYPR142C 564 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 OPY1YBR129C 987 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 UBP6YFR010W 1500 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 OLE1YGL055W 1533 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TDA6YPR157W 1404 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TRE2YOR256C 2430 nt3.93□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MEF1YLR069C 2286 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MET4YNL103W 2019 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TOS8YGL096W 831 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YJR012CYJR012C 624 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 ELF1YKL160W 438 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MTD1YKR080W 963 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MRPS17YMR188C 714 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 FEX1YOR390W 1128 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 FEX2YPL279C 1128 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YKR015CYKR015C 1707 nt3.92□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 VAC17YCL063W 1272 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RPS11AYDR025W 471 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RRG1YDR065W 1098 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TAF10YDR167W 621 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RNA15YGL044C 891 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YGL088WYGL088W 366 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 BNA1YJR025C 534 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 SWC7YLR385C 399 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MRPL39YML009C 213 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 YBL096CYBL096C 309 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 AIF1YNR074C 1137 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 RCL1YOL010W 1104 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 IDI1YPL117C 867 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 MET12YPL023C 1974 nt3.91□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 AIM14YGL160W 1713 nt3.9□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 PEP5YMR231W 3090 nt3.9□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 TED1YIL039W 1422 nt3.9□□□□□ -1.78
VAM3Q12241 VAC7YNL054W 3498 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 PER1YCR044C 1074 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 SPO73YER046W 432 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 JAC1YGL018C 555 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 GTF1YGR102C 552 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 GMH1YKR030W 822 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 YAL065CYAL065C 387 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 APS1YLR170C 471 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 RPS10BYMR230W 318 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 GPI12YMR281W 915 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 YPT53YNL093W 663 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 PSF3YOL146W 585 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 RFM1YOR279C 933 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 SUT2YPR009W 807 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 VPS69YPR087W 321 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 SAP4YGL229C 2457 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 YFL040WYFL040W 1623 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 ZPR1YGR211W 1461 nt3.9□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 ARG82YDR173C 1068 nt3.89□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 SNA2YDR525W-A 240 nt3.89□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 PPE1YHR075C 1203 nt3.89□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 YLR042CYLR042C 486 nt3.89□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 SIC1YLR079W 855 nt3.89□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 CDC42YLR229C 576 nt3.89□□□□□ -1.79
VAM3Q12241 ROK1YGL171W 1695 nt3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms