Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSRP1Q08945 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSRP1Q08945 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSRP1Q08945 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms