Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD300CQ08708 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CD300CQ08708 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms