Protein–RNA interactions for Protein: Q06190

PPP2R3A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R3AQ06190 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP2R3AQ06190 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP2R3AQ06190 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP2R3AQ06190 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R3AQ06190 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R3AQ06190 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms