Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	RMD5	YDR255C	1266 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SRB5	YGR104C	924 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YHL045W	YHL045W	348 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	IGO2	YHR132W-A	396 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YIL089W	YIL089W	618 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	UPS2	YLR168C	693 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	ELO3	YLR372W	1038 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	NCE102	YPR149W	522 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	UPC2	YDR213W	2742 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	PUT2	YHR037W	1728 nt		4.58	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SOL4	YGR248W	768 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SFH5	YJL145W	885 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	ATP12	YJL180C	978 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	CYC1	YJR048W	330 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YRA2	YKL214C	612 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	ORM2	YLR350W	651 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	BLS1	YLR408C	369 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YOL075C	YOL075C	3885 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YMR1	YJR110W	2067 nt		4.57	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YML020W	YML020W	1995 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	NPL4	YBR170C	1743 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	GRX6	YDL010W	696 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	CDA2	YLR308W	939 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YMR130W	YMR130W	909 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	PTA1	YAL043C	2358 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	VAC7	YNL054W	3498 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	AIP1	YMR092C	1848 nt		4.56	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YCR085W	YCR085W	354 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	MSW1	YDR268W	1140 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	ATP5	YDR298C	639 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	IRC6	YFR043C	714 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	RSF1	YMR030W	1131 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	MFM1	YPL060W	1242 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YPL077C	YPL077C	723 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YPL162C	YPL162C	822 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SET6	YPL165C	1122 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	NGL3	YML118W	1518 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SOF1	YLL011W	1470 nt		4.55	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YEL074W	YEL074W	339 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YHR173C	YHR173C	339 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YLR462W	YLR462W	609 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YNR061C	YNR061C	660 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	RPS19A	YOL121C	435 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	OM14	YBR230C	405 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	TFA1	YKL028W	1449 nt		4.54	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	SSL1	YLR005W	1386 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	FAR8	YMR029C	1572 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YCR050C	YCR050C	309 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	MRP13	YGR084C	1020 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YKE4	YIL023C	1041 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	FLD1	YLR404W	858 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	MET16	YPR167C	786 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	RIA1	YNL163C	3333 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.53	□□□□□ -1.68
MRD1	Q06106	LTV1	YKL143W	1392 nt		4.53	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TRF5	YNL299W	1929 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	CDC9	YDL164C	2268 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	VPS73	YGL104C	1461 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	NBP2	YDR162C	711 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YDR230W	YDR230W	348 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	WSS1	YHR134W	810 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	HIS5	YIL116W	1158 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YLR049C	YLR049C	1287 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	MCM1	YMR043W	861 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	DIP2	YLR129W	2832 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.52	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	ARO80	YDR421W	2853 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	YBR225W	YBR225W	2703 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	KTR2	YKR061W	1278 nt		4.51	□□□□□ -1.69
MRD1	Q06106	OMA1	YKR087C	1038 nt		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms