Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID5AQ03989 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID5AQ03989 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms