Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCNT1Q02742 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCNT1Q02742 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms